Human facial morphology is a combination of many complex traits and is determined by a large number of genes and enhancers. Here, we report a Copy Number Variation (CNV) study of enhancer hs1431 in populations of Central European and South Siberian ancestry. Central European samples included 97 Poles, while South Siberian samples included 78 Buryats and 27 Tuvinians. CNVs were detected by real-time PCR, using ViiA™ 7 Real-Time PCR System (Applied Biosystems). We revealed significant differences in CNV of hs1431 enhancer between Polish and Buryat population (p=0.0378), but not between Central European and South Siberian population (p=0.1225). Our results suggest that an increase in copy number variation of hs1431 enhancer is associated with biogeographic ancestry. However, this result needs extending and replicating in larger cohorts. This is the first study revealing the presence of copy number variation of enhancer hs1431 in humans.
Morfologia ludzkiej twarzy jest połączeniem wielu złożonych cech i determinowana jest przez dużą liczbę genów i wzmacniaczy. W niniejszym badaniu analizowano zmienność liczby kopii (CNV) wzmacniacza hs1431 w populacjach pochodzenia środkowoeuropejskiego i południowo-syberyjskiego. Próbki z Europy Środkowej pochodziły od 97 Polaków, natomiast próbki z południowej Syberii pochodziły od 78 Buriatów i 27 Tuwańczyków. CNV analizowano metodą real-time PCR z wykorzystaniem aparatu ViiA™ 7 (Applied Biosystems). Statystycznie istotne różnice w liczbie kopii wzmacniacza hs1431 występowały między populacjami polską a buriacką (p=0,0378), ale nie między populacjami Europy Środkowej i południowej Syberii (p=0,1225). Uzyskane wyniki sugerują, że wzrost liczby kopii wzmacniacza hs1431 jest związany z pochodzeniem biogeograficznym. Jednak wynik ten wymaga rozszerzenia i powtórzenia na większych kohortach. Jest to pierwsze badanie, w którym wykazano zmienności liczby kopii wzmacniacza hs1431 u ludzi.
Keywords: CNV; biogeographic ancestry; craniofacial development; enhancer.
Copyright © 2022 by PTMSiK.