Identification of amino acid substitutions associated with neutralization phenotype in the human immunodeficiency virus type-1 subtype C gp120

Virology. 2011 Jan 20;409(2):163-74. doi: 10.1016/j.virol.2010.09.031. Epub 2010 Oct 30.

Abstract

Neutralizing antibodies (Nabs) are thought to play an important role in prevention and control of HIV-1 infection and should be targeted by an AIDS vaccine. It is critical to understand how HIV-1 induces Nabs by analyzing viral sequences in both tested viruses and sera. Neutralization susceptibility to antibodies in autologous and heterologous plasma was determined for multiple Envs (3-6) from each of 15 subtype-C-infected individuals. Heterologous neutralization was divided into two distinct groups: plasma with strong, cross-reactive neutralization (n=9) and plasma with weak neutralization (n=6). Plasma with cross-reactive heterologous Nabs also more potently neutralized contemporaneous autologous viruses. Analysis of Env sequences in plasma from both groups revealed a three-amino-acid substitution pattern in the V4 region that was associated with greater neutralization potency and breadth. Identification of such potential neutralization signatures may have important implications for the development of HIV-1 vaccines capable of inducing Nabs to subtype C HIV-1.

Publication types

  • Research Support, N.I.H., Extramural
  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Adult
  • Amino Acid Substitution / genetics*
  • Antibodies, Neutralizing / immunology*
  • Cross Reactions
  • Epitopes / genetics
  • Epitopes / immunology*
  • Female
  • HIV Antibodies / immunology*
  • HIV Envelope Protein gp120 / genetics
  • HIV Envelope Protein gp120 / immunology*
  • HIV-1 / genetics
  • HIV-1 / immunology*
  • Humans
  • Male
  • Middle Aged
  • Molecular Sequence Data
  • Neutralization Tests
  • Sequence Analysis, DNA

Substances

  • Antibodies, Neutralizing
  • Epitopes
  • HIV Antibodies
  • HIV Envelope Protein gp120
  • gp120 protein, Human immunodeficiency virus 1

Associated data

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